4月13日よりEssential Bioinformatics for Global LeadersⅡを開講いたします。この科目はグローバル理工学副専攻の履修科目になっていますが、博士前期・後期課程に所属し、関心のある学生であれば、どなたでも履修することができます。なお、講義は英語で行われます。
本講座の趣旨
Theme & Objective: Bioinformatics is an interdisciplinary research area at the interface between biological science and computational science, the ultimate goal of which is to better understand living cells and their functioning at the molecular level. It involves the technologies that use computers for the storage, retrieval, manipulation, understanding and distribution of information related to biological macromolecules such as DNA, RNA, protein, and even more. To take benefit of these classes, it is recommended either to have a basic knowledge in molecular and cell biology or to have attended Essential Bioinformatics for Global Leaders I. These advanced classes aim at demonstrating the students how to apply computational methods to the analysis of data from high throughput techniques in the biological field. This course will give the students examples of common use of bioinformatics in the biological field and provide them with a practical experience with computer practice and wet lab sessions.
学生へのメッセージ
This class will be a great opportunity for you to know everything about very various useful bioinformatics applications among them, microarray technique. You will be especially given the opportunity to follow a real microarray experiment from beginning to end (wet lab and computational data analysis practice). Do not hesitate to join us in this fun experience!
講義概要
| 科目名 | Essential Bioinformatics for Global LeadersⅡ ［16S1010］ | ||
| 講師 | Gouraud, Sabine （お茶の水女子大学プロジェクト教育研究院特任准教授） BASHAR, Md Khayrul （お茶の水女子大学プロジェクト教育研究院特任准教授 |
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| 対象 | 博士前期・後期課程 | ||
| 内容 | 日時 | 場所 | 講義テーマ |
| 4月13日(水) 13:20～14:50 |
人間文化研究科棟 102室 | Introduction to the “omics” and high-throughput methods [style: lecture and discussion]. | |
| 4月20日(水) 13:20～14:50 |
人間文化研究科棟 102室 | Proteomics: example of 2D DIGE combined with mass spectrometry technique [style: lecture and discussion] | |
| 4月27日(水) 13:20～14:50 |
理学部2号館 202室 | Lab*:Protein expression in Rat Brain I. Immunohistochemistry method [style: wet lab] | |
| 5月11日(水) 13:20～14:50 |
理学部2号館 202室 | Lab*: Protein expression in Rat Brain II. Confocal microscopy [style: wet lab] | |
| 5月25日(水) 13:20～14:50 Bashar, MD Khayrul |
人間文化研究科棟 102室 | Introduction to bio-image informatics. Concepts and theories for object segmentation from images, Algorithms for image objects segmentation. [Style: Lecture and computer demonstration] | |
| 6月1日(水) 13:20～14:50 Bashar, MD Khayrul |
人間文化研究科棟 102室 | Cell nuclei segmentation and analysis from confocal images. [Style: computer practice] | |
| 6月 8日(水) 13:20～14:50 |
人間文化研究科棟 102室 | Functional genomic database and gene classification: Genomic Expression database (GEO), KEGG pathway database, Geneontology classification (GO)……. [style: lecture, computer practice and discussion] | |
| 6月15日(水) 13:20～14:50 Bashar, MD Khayrul |
人間文化研究科棟 102室 | Basic machine learning concept and theories, two algorithms for supervised and unsupervised machine learning with examples. [Style: Lecture and discussion] | |
| 6月22日(水) 13:20～14:50 Bashar, MD Khayrul |
人間文化研究科棟 102室 | Disease classification using machine learning algorithm [Style: Computer Practice] | |
| 6月29日(水) 13:20～14:50 | 人間文化研究科棟 102室 | Transcriptomics I: Microarray technique description [style: lecture] | |
| 7月 6日(水) 13:20～16:30 |
理学部2号館 202室 | Transcriptomics II: Microarray experiment Demo [style: wet lab] | |
| 7月13日(水) 13:20～14:50 |
人間文化研究科棟 102室 | Transcriptomics III: Microarray Data analysis I with DAVID/MeV software [style: computer practice and discussion] | |
| 7月20日(水) 13:20～14:50 |
人間文化研究科棟 102室 | Transcriptomics IV: Microarray Data analysis II with Genespring/Pathway Studio software [style: computer practice and discussion] | |
| 7月27日(水) 13:20～14:50 |
人間文化研究科棟 102室 | Conclusion: Other bioformatics applications to “omics” studies [style: discussion over scientific paper] | |
履修登録
履修登録期間： 4月 8日 ～ 4月22日
上記登録期間内に登録ができなかった場合は、学生センター棟1階学務課にご相談ください。
お問合せ
お茶の水女子大学 リーディング大学院推進センター
Tel: 03-5978-5775
E-mail:
